Πίνακας περιεχομένων:
- Είναι το BLAST μια κύρια βάση δεδομένων;
- Είναι το NCBI βάση δεδομένων;
- Χρησιμοποιείται το BLAST μόνο σε βάσεις δεδομένων NCBI;
- Πώς λειτουργεί η βάση δεδομένων BLAST;
Βίντεο: Είναι το blast μια βάση δεδομένων;
2024 Συγγραφέας: Fiona Howard | [email protected]. Τελευταία τροποποίηση: 2024-01-10 06:35
Το
BLAST είναι ένας αλγόριθμος υπολογιστή που είναι διαθέσιμος για χρήση στο διαδίκτυο στον ιστότοπο του Εθνικού Κέντρου Πληροφοριών Βιοτεχνολογίας (NCBI), καθώς και σε πολλούς άλλους ιστότοπους. Το BLAST μπορεί γρήγορα να ευθυγραμμίσει και να συγκρίνει μια αλληλουχία DNA ερωτήματος με μια βάση δεδομένων αλληλουχιών, γεγονός που το καθιστά κρίσιμο εργαλείο στη συνεχιζόμενη γονιδιωματική έρευνα.
Είναι το BLAST μια κύρια βάση δεδομένων;
Το
BLAST είναι το πιο ευρέως χρησιμοποιούμενο λογισμικό στην έρευνα της βιοπληροφορικής. Η κύρια λειτουργία του είναι να συγκρίνει μια ακολουθία ενδιαφέροντος, την ακολουθία ερωτημάτων, με ακολουθίες σε μια μεγάλη βάση δεδομένων BLAST και στη συνέχεια αναφέρει τις καλύτερες αντιστοιχίσεις ή «επιτυχίες» που βρέθηκαν στη βάση δεδομένων. Αυτό το απλό πρόγραμμα έχει δύο κύριες εφαρμογές.
Είναι το NCBI βάση δεδομένων;
Το NCBI φιλοξενεί μια σειρά βάσεων δεδομένων σχετικών με τη βιοτεχνολογία και τη βιοϊατρική και αποτελεί σημαντικό πόρο για εργαλεία και υπηρεσίες βιοπληροφορικής. Στις κύριες βάσεις δεδομένων περιλαμβάνονται η GenBank για αλληλουχίες DNA και η PubMed, μια βιβλιογραφική βάση δεδομένων για τη βιοϊατρική βιβλιογραφία. Άλλες βάσεις δεδομένων περιλαμβάνουν τη βάση δεδομένων NCBI Epigenomics.
Χρησιμοποιείται το BLAST μόνο σε βάσεις δεδομένων NCBI;
Το
BLAST είναι διαθέσιμο στον ιστό στον ιστότοπο του NCBI. Διαφορετικοί τύποι BLAST είναι διαθέσιμοι σύμφωνα με τις αλληλουχίες ερωτημάτων και τις βάσεις δεδομένων-στόχων.
Πώς λειτουργεί η βάση δεδομένων BLAST;
Πώς λειτουργεί το BLAST; Το BLAST προσδιορίζει ομόλογες αλληλουχίες χρησιμοποιώντας μια ευρετική μέθοδο που αρχικά βρίσκει σύντομες αντιστοιχίσεις μεταξύ δύο αλληλουχιών. Έτσι, η μέθοδος δεν λαμβάνει υπόψη ολόκληρο τον χώρο ακολουθίας. Μετά την αρχική αντιστοίχιση, το BLAST επιχειρεί να ξεκινήσει τοπικές ευθυγραμμίσεις από αυτές τις αρχικές αντιστοιχίσεις.
Συνιστάται:
Τι είναι οι αναζητήσεις στη βάση δεδομένων;
Οι αναζητήσεις είναι μια διαισθητική σύνταξη σύνδεσης πίνακα που παρέχεται για την απλούστευση της ενοποίησης δεδομένων και των ερωτημάτων SQL Αντιπροσωπεύουν σχέσεις ξένων κλειδιών μεταξύ πινάκων και αφού δημιουργηθούν, μπορούν να χρησιμοποιηθούν για την "
Είναι το redcap μια σχεσιακή βάση δεδομένων;
Το REDCap είναι μια εφαρμογή που βασίζεται στον ιστό, που χρησιμοποιείται για το σχεδιασμό και τη διαχείριση βάσεων δεδομένων και ερευνών. … Ωστόσο, χρησιμοποιεί τις λειτουργίες του Συστήματος Διαχείρισης Σχεσιακών Βάσεων Δεδομένων (RDBMS από τον διακομιστή βάσης δεδομένων) για την αποθήκευση δεδομένων σε πίνακες με καλά καθορισμένες σχέσεις (χρησιμοποιώντας περιορισμούς πρωτεύοντος και ξένου κλειδιού) .
Είναι το endnote βάση δεδομένων;
Οι περισσότερες βιβλιογραφικές βάσεις δεδομένων επιτρέπουν στους χρήστες να εξάγουν αναφορές στις βιβλιοθήκες EndNote τους. … Ο χρήστης μπορεί στη συνέχεια να εισάγει τις παραπομπές στο λογισμικό EndNote. Είναι επίσης δυνατή η αναζήτηση καταλόγων βιβλιοθηκών και δωρεάν βάσεων δεδομένων, όπως το PubMed, μέσα από το ίδιο το πρόγραμμα λογισμικού EndNote.
Τι είναι η βάση δεδομένων Swiss Prot;
Το SWISS-PROT είναι μια επιμελημένη βάση δεδομένων αλληλουχιών πρωτεΐνης που προσπαθεί να παρέχει υψηλό επίπεδο σχολιασμών (όπως η περιγραφή της λειτουργίας μιας πρωτεΐνης, η δομή των τομέων της, μετα-μεταφραστικές τροποποιήσεις, παραλλαγές, κ.
Σε μια βάση δεδομένων τα σχετικά πεδία ομαδοποιούνται σε;
Εγγραφή δεδομένων Τι είναι μια ομάδα πεδίων σε μια βάση δεδομένων που είναι γνωστή ως; Μια εγγραφή αποτελείται από πεδία, με κάθε πεδίο να περιγράφει ένα χαρακτηριστικό της οντότητας. Αρχείο - μια ομάδα σχετικών εγγραφών. … Βάση δεδομένων - είναι μια ολοκληρωμένη συλλογή λογικά σχετικών εγγραφών ή αρχείων .