Η
Μεταγονιδιωματική ορίζεται ως η άμεση γενετική ανάλυση των γονιδιωμάτων που περιέχονται με ένα περιβαλλοντικό δείγμα Το πεδίο ξεκίνησε αρχικά με την κλωνοποίηση του περιβαλλοντικού DNA, ακολουθούμενη από έλεγχο λειτουργικής έκφρασης [1], και στη συνέχεια γρήγορα συμπληρώθηκε με άμεση τυχαία αλληλουχία κυνηγετικού όπλου του περιβαλλοντικού DNA [2, 3].
Ποια είναι η διαδικασία της μεταγονιδιωματικής;
Μεταγονιδιωματική περιλαμβάνει τη λήψη DNA από όλους τους μικροοργανισμούς εντός μιας κοινότητας, χωρίς απαραίτητα να ταυτοποιούνται όλα τα εμπλεκόμενα είδη. Αφού προσδιοριστεί η αλληλουχία των γονιδίων και συγκριθούν με ταυτοποιημένες αλληλουχίες, μπορούν να προσδιοριστούν οι λειτουργίες αυτών των γονιδίων.
Ποια τεχνική χρησιμοποιείται στη μεταγονιδιωματική;
Συλλέγεται δείγμα της μικροβιακής κοινότητας από θαλασσινό νερό, ίζημα, ζώο ξενιστή ή άλλο θαλάσσιο βιότοπο. Τα συλλεχθέντα κύτταρα στη συνέχεια λύονται και το DNA εξάγεται από το λύμα τους. Η τεχνική που καθιστά δυνατή τη μεταγονιδιωματική είναι η αλληλουχία κυνηγετικού όπλου, η οποία ταξινομεί τυχαίες περιοχές του DNA με μη στοχευμένο τρόπο.
Ποια είναι τα 3 βήματα για τη μελέτη της μεταγονιδιωματικής;
Βήματα και διαδικασία μεταγονιδιωματικής:
- Συλλογή δειγμάτων:
- εξαγωγή DNA:
- Προετοιμασία δείγματος:
- Ανάλυση δείγματος:
Πώς εκτελείται η λειτουργική μεταγονιδιωματική;
Η λειτουργική μεταγονιδιωματική περιλαμβάνει απομόνωση DNA από μικροβιακές κοινότητες για τη μελέτη των λειτουργιών των κωδικοποιημένων πρωτεϊνών. Περιλαμβάνει την κλωνοποίηση θραυσμάτων DNA, την έκφραση γονιδίων σε έναν υποκατάστατο ξενιστή και τον έλεγχο για ενζυμικές δραστηριότητες.
