Η επιδιόρθωση κατευθυνόμενη με ομολογία είναι ένας μηχανισμός στα κύτταρα για την επιδιόρθωση αλλοιώσεων του δίκλωνου DNA. Η πιο κοινή μορφή HDR είναι ο ομόλογος ανασυνδυασμός. Ο μηχανισμός HDR μπορεί να χρησιμοποιηθεί από το κύτταρο μόνο όταν υπάρχει ένα ομόλογο κομμάτι DNA στον πυρήνα, κυρίως στη φάση G2 και S του κυτταρικού κύκλου.
Πώς γίνεται επισκευή κατευθυνόμενη από ομολογία;
Η κατευθυνόμενη από ομολογία επιδιόρθωση (HDR) είναι ένας μηχανισμός στα κύτταρα για την επιδιόρθωση αλλοιώσεων δίκλωνου DNA … Άλλα παραδείγματα επισκευής κατευθυνόμενης από ομολογία περιλαμβάνουν ανόπτηση μονής έλικος και πρόκληση θραύσης αντιγραφή. Όταν το ομόλογο DNA απουσιάζει, λαμβάνει χώρα μια άλλη διαδικασία που ονομάζεται μη ομόλογη σύνδεση άκρου (NHEJ).
Πώς λειτουργεί η επισκευή κατευθυνόμενη από ομολογία στο Crispr;
Ο διεισδυτικός κλώνος μπορεί στη συνέχεια να εκτοπίσει έναν κλώνο του ομόλογου διπλού DNA και να ζευγαρώσει με τον άλλο. Αυτό έχει ως αποτέλεσμα το σχηματισμό του υβριδικού DNA που αναφέρεται ως βρόχος μετατόπισης (D loop). Αυτό είναι το καθοριστικό σημείο του HDR. Τα ενδιάμεσα ανασυνδυασμού μπορούν να επιλυθούν για να ολοκληρωθεί η διαδικασία επιδιόρθωσης του DNA.
Ποια είναι η διαφορά μεταξύ μη ομόλογης σύνδεσης άκρου και επιδιόρθωσης κατευθυνόμενης από ομολογία;
Ποια είναι η διαφορά μεταξύ της μη ομόλογης σύνδεσης άκρου (NHEJ) και της επιδιόρθωσης κατευθυνόμενης από ομολογία (HDR); … Στον πυρήνα του, τα NHEJ-break άκρα μπορούν να συνδεθούν χωρίς ομόλογο πρότυπο, ενώ τα διαλείμματα HDR απαιτούν ένα πρότυπο για την καθοδήγηση της επισκευής. Το NHEJ είναι ένας πολύ αποτελεσματικός μηχανισμός επιδιόρθωσης που είναι πιο ενεργός στο κύτταρο.
Πόση ώρα διαρκεί η επισκευή κατευθυνόμενη από ομολογία;
Εδώ, εκμεταλλευόμαστε την ίδια στρατηγική για να εξερευνήσουμε τους μηχανισμούς αντίδρασης της επιδιόρθωσης κατευθυνόμενης από ομολογία χρησιμοποιώντας έναν δότη DNA μονής έλικος με δύο σκέλη ομολογίας με την περιοχή στόχο. Το σύστημα περιγράφεται στο σχήμα 1 και η συνολική αντίδραση διαρκεί ~16 h για να ολοκληρωθεί.