Πολυβικιτίνη ήταν από καιρό γνωστή ως οι «κανονικές» πρωτεΐνες στόχευσης σήματος για αποικοδόμηση από το πρωτεάσωμα.
Τι είναι ένα σήμα για την αποικοδόμηση πρωτεΐνης;
Ένα σήμα αποικοδόμησης ή 'degron' 10, ορίζεται συνήθως ως ένα ελάχιστο στοιχείο εντός μιας πρωτεΐνης που επαρκεί για αναγνώριση και αποικοδόμηση από μια πρωτεολυτική συσκευή. Μια σημαντική ιδιότητα των degrons είναι ότι είναι μεταβιβάσιμα.
Πώς συμβαίνει η πρωτεασωμική αποικοδόμηση των πρωτεϊνών;
Οι πρωτεΐνες επισημαίνονται για αποικοδόμηση με η προσκόλληση της ουβικιτίνης στην αμινομάδα της πλευρικής αλυσίδας ενός υπολείμματος λυσίνηςΣτη συνέχεια προστίθενται επιπλέον ουβικιτίνες για να σχηματιστεί μια αλυσίδα πολυουβικιτίνης. Τέτοιες πολυουβικινωμένες πρωτεΐνες αναγνωρίζονται και αποικοδομούνται από ένα μεγάλο σύμπλεγμα πρωτεάσης πολλαπλών υπομονάδων, που ονομάζεται πρωτεάσωμα.
Πού συμβαίνει η πρωτεασωμική αποικοδόμηση;
Οι περισσότερες κυτταρικές πρωτεΐνες αποδομούνται από το πρωτεάσωμα 26S
Αυτή η δομή βρίσκεται στον τον πυρήνα και το κυτταρόπλασμα όλων των κυττάρων και αποτελεί περίπου το 1 έως 2% του κυτταρική μάζα (39).
Τι στοχεύει μια πρωτεΐνη για αποικοδόμηση;
Στα ευκαρυωτικά κύτταρα, μια εξαρτώμενη από το ATP πρωτεάση που ονομάζεται πρωτεάσωμα είναι υπεύθυνη για μεγάλο μέρος αυτής της πρωτεόλυσης. Οι πρωτεΐνες στοχεύουν στην πρωτεασωμική αποικοδόμηση από ένα απογόνιο δύο μερών, το οποίο αποτελείται από ένα σήμα δέσμευσης πρωτεασώματος και μια θέση έναρξης αποικοδόμησης.
