1.1 α-Ελικες. Η α-έλικα είναι ένα κοινό στοιχείο της δευτερογενούς δομής της πρωτεΐνης, που σχηματίζεται όταν τα αμινοξέα «τυλίγονται» για να σχηματίσουν μια δεξιόστροφη έλικα όπου οι πλευρικές αλυσίδες δείχνουν από το κεντρικό πηνίο (Εικ. 3.1A, B).
Τι προκαλεί το σχηματισμό άλφα ελίκων;
Η άλφα έλικα χαρακτηρίζεται από μια σφιχτή συστροφή με το δεξί χέρι στην αλυσίδα αμινοξέων που την κάνει να σχηματίζει σχήμα ράβδου. Οι δεσμοί υδρογόνου μεταξύ του υδρογόνου σε μια αμινομάδα και του οξυγόνου σε μια ομάδα καρβοξυλίου στο αμινοξύ προκαλούν αυτή τη δομή.
Πώς σχηματίζονται οι άλφα έλικες και τα φύλλα βήτα;
Η άλφα έλικα σχηματίζεται όταν οι πολυπεπτιδικές αλυσίδες συστρέφονται σε μια σπείρα Αυτό επιτρέπει σε όλα τα αμινοξέα της αλυσίδας να σχηματίσουν δεσμούς υδρογόνου μεταξύ τους.… Το βήτα πτυχωτό φύλλο είναι πολυπεπτιδικές αλυσίδες που εκτείνονται κατά μήκος της άλλης. Ονομάζεται πτυχωτό φύλλο λόγω της εμφάνισης που μοιάζει με κύμα.
Τι αμινοξέα σχηματίζουν έλικες;
Διαφορετικές αλληλουχίες αμινοξέων έχουν διαφορετικές τάσεις για σχηματισμό α-ελικοειδούς δομής. Μεθειονίνη, αλανίνη, λευκίνη, γλουταμινικό και λυσίνη αφόρτιστα ("MALEK" στους κωδικούς αμινοξέων 1-γράμματος) έχουν όλα ιδιαίτερα υψηλές τάσεις σχηματισμού έλικα, ενώ η προλίνη και η γλυκίνη έχουν φτωχές τάσεις σχηματισμού έλικα.
Πώς σχηματίζεται η δομή της δευτεροταγούς πρωτεΐνης από την πρωτογενή δομή;
Η πρωτογενής δομή μιας πρωτεΐνης ορίζεται αποκλειστικά από την αλληλουχία αμινοξέων της και κατασκευάζεται από πεπτιδικούς δεσμούς μεταξύ γειτονικών υπολειμμάτων αμινοξέων. Η δευτερογενής δομή προκύπτει από δεσμούς υδρογόνου κατά μήκος της ραχοκοκαλιάς του πολυπεπτιδίου, με αποτέλεσμα άλφα-έλικες και βήτα πτυχωμένα φύλλα.
